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Markers

This is our current standard marker panel for genome scans. Markers used in fine mapping are not shown. Our 1998 marker set is found here.


locus    genetic  hetero-   number of
        position  zygosity   alleles
            [cM]

Chromosome 1

D1S243         0    0.86      11
D1S468       6.2    0.75       9
D1S214      16.4    0.79      10
D1S244      22.9    0.78      11
D1S228      32.4    0.76       7
D1S436      39.9    0.75      12
D1S478      49.6    0.73       7
D1S233      62.3    0.85      10
D1S193      73.8    0.77       6
D1S200      84.3    0.79       9
D1S209      95.9    0.79       9
D1S219     103.3    0.81       9
D1S2876    109.6    0.85      11
D1S207     117.6    0.83      13
D1S435     128.9    0.73       7
D1S206     137.6    0.81       7
D1S221     146.6    0.75       6
D1S252     155.1    0.81       8
D1S498     160.7    0.81      10
D1S484     173.9    0.63       4
D1S431     187.2    0.79       7
D1S2640    199.7    0.77       9
D1S422     209.4    0.76       6
D1S2655    221.1    0.89      16
D1S2891    228.7    0.74      10
D1S419     237.2    0.85      14
D1S251       249    0.81       9
D1S235     258.7    0.68       7
D1S2785    269.7    0.76       8
D1S2842    277.3    0.76       8
D1S102       280    0.47
D1S2682    292.7    0.76       7


Chromosome 2

D2S319         6    0.72       6
D2S281      12.6    0.81       9
D2S287      22.4    0.74       8
D2S168      28.6    0.82       9
D2S2375     40.7    0.82       8
D2S2168       48    0.86      11
D2S2374     58.3    0.84      12
D2S2294     68.2    0.76       8
D2S123      77.1    0.76       8
D2S393      83.5    0.82       9
D2S2113     92.3    0.83      12
D2S139       106    0.81       9
D2S2216    115.3    0.76       8
D2S160     127.4    0.78       7
D2S383     136.8    0.75       8
D2S368     148.5     0.8       9
D2S151     156.4     0.8       8
D2S142     166.3    0.76       6
D2S2157    175.1    0.79       9
D2S294     180.7    0.85      10
D2S364     192.9    0.79       9
D2S116     204.7    0.77       9
D2S143       217    0.82       9
D2S377     228.2     0.7       4
D2S396     240.2    0.83      10
D2S331       250    0.72       5
D2S345     258.7     0.7       7
D2S125     269.5    0.82       7
D2S2338      277    0.55       4


Chromosome 3

D3S1270        0    0.75       9
D3S1560     12.9    0.81       9
D3S1597     24.1    0.79       9
D3S1286     35.8    0.88      14
D3S1266     46.9    0.72       5
D3S1298     56.7    0.87      12
D3S1578     67.9    0.87      14
D3S1300       79    0.82       9
D3S1285       91    0.72       6
D3S1566     97.2    0.83       9
D3S3633      108    0.81       9
D3S1595    111.4     0.8      11
D3S2459    119.2    0.84
D3S1278    131.8    0.86      13
D3S1267    141.1    0.87      13
D3S1292    148.7    0.84      10
D3S1569      162    0.79      11
D3S1594      173    0.86      12
D3S1264    181.4    0.79       6
D3S3725    188.2    0.84       9
D3S3730    198.4    0.82       9
D3S1262    207.2    0.79       8
D3S3663    220.3    0.76       9
D3S1265      228    0.84      10
D3S3550      233    0.74       6


Chromosome 4

D4S3038        0    0.78       8
D4S432       5.4    0.74       7
D4S394      14.5    0.74       8
D4S403      24.9    0.76       7
D4S419      32.6    0.76       7
D4S418      43.9    0.77       9
D4S405      56.7    0.85       1
D4S428      63.9    0.76       8
D4S398      71.5    0.82      11
D4S3042     81.9    0.84      12
D4S2963       86    0.68       9
D4S395      90.8    0.83      12
D4S1560    103.1    0.77      10
D4S406     115.8    0.87      12
D4S430     125.1     0.8       9
D4S1575    131.9    0.64       3
D4S424     143.8    0.83       8
D4S1548    153.6    0.77       9
D4S393     160.9    0.72       7
D4S1597    169.1    0.75      10
D4S1595    178.4    0.72       6
D4S1607    187.2    0.82       9
D4S1535    198.5    0.77       8
D4S2924    203.7    0.72       9
D4S2930    212.2     0.8       9


Chromosome 5

D5S2005        0    0.71       6
D5S406      10.7    0.78      10
D5S667      21.4    0.86      16
D5S486        31    0.74      10
D5S419      39.5     0.8      11
D5S674      46.8    0.77       6
D5S418      58.1     0.8       9
D5S398      68.4    0.81       7
D5S2036     75.3    0.78       7
D5S1962     82.8    0.79      12
D5S617      95.5     0.8       8
D5S644     104.5    0.84      10
D5S2084    114.7     0.7      11
D5S421     121.4    0.82       8
D5S1984      135    0.73      10
D5S402     147.1    0.61       3
D5S410       156    0.79       9
D5S422     163.9    0.84      10
D5S671     173.2    0.81       8
D5S425     179.1    0.77       9
D5S498     184.7    0.78       7
D5S408     195.8    0.73       7


Chromosome 6

D6S344       1.4    0.72       9
D6S309      13.6    0.83      10
D6S1653     25.9    0.75      12
D6S260      29.6    0.84      11
D6S422      35.7    0.77      10
D6S276      44.9    0.83      11
D6S291      49.8     0.7       7
D6S426      60.7    0.84       9
D6S452      72.2    0.84       9
D6S455      83.6    0.75       8
D6S286        90    0.78      13
D6S1570       99    0.78       8
D6S434     109.2    0.85      18
D6S268     114.8    0.74       7
D6S1715      126    0.83       8
D6S292     138.2    0.82      10
D6S311     148.2    0.92      27
D6S442     158.5    0.79       6
D6S305     166.6    0.83       9
D6S264     179.1    0.69       6
D6S446     188.4    0.62       6
D6S281     201.1    0.68       8


Chromosome 7

D7S531       4.8    0.78       7
D7S641      15.2    0.71       6
D7S664        21     0.7       6
D7S507      29.1    0.88      11
D7S673      38.8    0.86      11
D7S2496     47.9    0.71      10
D7S2251     55.7    0.87      10
D7S691      64.6    0.74       8
D7S663      79.6     0.8      11
D7S669      90.9     0.8       8
D7S2410    101.2    0.84      10
D7S2446    114.6    0.87      12
D7S2420    120.7     0.8       9
D7S635     132.6    0.81      10
D7S2437    140.6    0.81      13
D7S684     149.6     0.8       9
D7S661     157.5    0.75      10
D7S636       165     0.9      14
D7S2462    172.3    0.84      10
D7S2423      184    0.71       6


Chromosome 8

D8S504         0    0.71       5
D8S277       8.4    0.73      12
D8S550      20.4    0.86      12
D8S511      29.5    0.67       6
D8S560      42.2    0.75       6
D8S1771     49.6    0.75       9
D8S532      64.6    0.83       9
D8S285      70.6    0.77       8
D8S553      81.5    0.83      10
D8S286      93.5     0.8       7
D8S270     102.1    0.79       6
D8S556     116.8    0.79       8
D8S514     128.9    0.76       9
D8S263     140.6    0.67       8
D8S272     152.5    0.81      10
D8S1741    161.5    0.84      10
D8S1836    166.4    0.84      14
D8S2334    168.4    0.78


Chromosome 9

D9S1779      0.1    0.63       8
D9S288       8.8    0.84       9
D9S286      16.8    0.87      12
D9S156      29.5    0.79      15
D9S1846     36.5    0.69       7
D9S169      48.2    0.62       9
D9S1874     59.9    0.83       7
D9S175      68.8    0.84      15
D9S1674     75.8    0.73       8
D9S1812     86.6    0.69       5
D9S283      93.2     0.8      10
D9S176     104.9    0.81       9
D9S1784      112    0.88      13
D9S279     120.4    0.78       6
D9S275     129.2    0.61       4
D9S1798    136.7    0.68       6
D9S159     142.7    0.79       9
D9S164     148.1     0.8       7
D9S1826    160.2    0.69       7
D9S1838    166.5    0.83       9


Chromosome 10

D10S249        0    0.74       8
D10S591     12.3    0.71       5
D10S189     17.3    0.72       4
D10S547     28.1    0.75       8
D10S191     36.3    0.81      12
D10S595     44.8    0.84      12
D10S213     56.9    0.82       9
D10S1791    66.9    0.72       6
D10S539     75.4    0.75       8
D10S581     84.9    0.79      12
D10S537     93.8    0.82       9
D10S1699   100.5    0.63       5
D10S1765   114.3    0.83      10
D10S583      122    0.83       9
D10S603      131    0.74      11
D10S543    136.3    0.76      10
D10S187    143.9    0.81      12
D10S587    156.6    0.79       8
D10S217    167.2     0.8       9
D10S212    180.7     0.7       6


Chromosome 11

D11S922      3.2    0.92      19
D11S1338    14.9    0.74       6
D11S902     24.7     0.8      10
D11S904       37    0.82       7
D11S935     49.6    0.73       6
D11S1313    63.2    0.85      10
D11S4095      71    0.64       5
D11S1314    77.5    0.77       9
D11S901     89.9    0.82       8
D11S898    103.1    0.79       9
D11S927    108.7    0.85       9
D11S4127   117.3    0.71       7
D11S925    123.5    0.84      11
D11S934    131.7    0.84      11
D11S910    145.6    0.71       6
D11S968    152.8    0.81       9


Chromosome 12

D12S352        0    0.72       8
D12S314     12.6     0.8       8
D12S77      21.8    0.87      13
D12S364     31.7    0.86      14
D12S1682    39.7    0.77      10
D12S87      53.3    0.79       9
D12S368     67.3     0.8       8
D12S83      76.5     0.8       8
D12S92      84.2    0.75       8
D12S1684    87.6     0.9      15
D12S88      95.8    0.84      10
D12S306    106.7    0.84      10
D12S330    116.6    0.73      12
D12S79     126.1    0.88      12
D12S395    137.5    0.76
D12S324    148.3    0.69       6
D12S97     160.9    0.68       7
D12S357    169.1    0.84      11


Chromosome 13

D13S1316       0    0.43       5
D13S1275     8.8    0.82       8
D13S221     14.6    0.82       8
D13S171     27.3    0.72       6
D13S263     40.4    0.84       9
D13S262     47.5     0.8       9
D13S156     57.3     0.8       8
D13S265     70.6     0.7       9
D13S159     81.5    0.89      24
D13S274     89.4    0.69       5
D13S286     95.9    0.77       8
D13S1315   105.2    0.79       9
D13S285    112.8     0.8       8


Chromosome 14

D14S261        0    0.75       7
D14S72       2.1    0.82       7
D14S283      7.5    0.81       9
D14S1032    16.9    0.72       7
D14S1034    25.3    0.74       5
D14S70      32.9    0.75       5
D14S991     46.8    0.67       8
D14S63        59    0.76       9
D14S1002    67.1    0.78       8
D14S983     76.4    0.82      10
D14S68      86.3    0.91      16
D14S977     97.7     0.8      12
D14S1054   103.7    0.76       8
D14S1006   117.1    0.76       9
D14S1007   128.6    0.77       7


Chromosome 15

D15S1234       7
D15S165     20.2    0.79      10
D15S1042    32.3    0.82      10
D15S126     45.5    0.82      11
D15S1033      52    0.69       7
D15S153     62.1    0.86      12
D15S114     72.3     0.7       6
D15S127     84.8    0.85      14
D15S130       98    0.66       7
D15S966    110.2    0.82       9


Chromosome 16

D16S521        0    0.71       7
D16S423      8.4    0.73      10
D16S407     16.7    0.84      10
D16S405       27    0.76       8
D16S3036    37.1    0.83       9
D16S3116    49.6    0.77       8
D16S411     57.8    0.78       6
D16S415     65.6    0.72       8
D16S3039    72.6    0.73       6
D16S514       80    0.82       9
D16S515     90.2     0.8      11
D16S3096    97.3    0.73       9
D16S3040   102.3    0.74       7
D16S511    108.4    0.89      17
D16S3037   119.2    0.71       7
D16S413    126.5    0.83      13


Chromosome 17

D17S1529     3.4    0.81       9
D17S938     14.8    0.76       7
D17S954     23.2    0.72       6
D17S1856    36.4    0.72       7
D17S953     44.2    0.75       8
D17S798     53.9     0.8       7
D17S791       65    0.87      15
D17S790     75.7    0.77       8
D17S948     84.1    0.82      11
D17S949     94.9     0.8       8
D17S802    108.2    0.81      10
D17S784    117.7    0.77       7
D17S928    128.7    0.75      11


Chromosome 18

D18S59       0.1    0.81       8
D18S63       7.9    0.79       9
D18S452     17.7    0.83      10
D18S1163    24.3    0.51       7
D18S1153    34.7    0.78      10
D18S53      40.4    0.79      10
D18S1104    48.9    0.87      13
D18S56      56.7    0.73       6
D18S57      63.2    0.86      11
D18S474     71.3    0.82       9
D18S64        83    0.73       8
D18S68      94.4    0.78      10
D18S1125   103.7    0.76       9
D18S58     109.1    0.73      10
D18S70     123.8    0.83      10


Chromosome 19

D19S209     10.8    0.76       7
D19S216     19.1    0.75       5
D19S922       26    0.84       8
D19S221     35.5    0.86      10
D19S226     41.7    0.84      12
D19S1037    46.9    0.78
D19S414     53.2    0.77       7
D19S220     61.4    0.84      10
D19S412     69.9     0.8       9
D19S907     81.7    0.64       4
D19S921     91.7    0.78       8
D19S210    104.9    0.73       6


Chromosome 20

D20S117      2.9    0.83      11
D20S116       11    0.79       6
D20S917       25     0.8      11
D20S186     33.2    0.85      11
D20S112     39.3    0.81      10
D20S101     48.1    0.62       8
D20S107     54.9    0.79      10
D20S119       61    0.82       8
D20S109     73.6    0.88      15
D20S120     82.1    0.85      10
D20S171     94.4    0.66       8


Chromosome 21

D21S1911     0.1    0.69       8
D21S1256     8.6    0.65       5
D21S1905    14.6    0.77       7
D21S265     24.1    0.84       8
D21S1908    31.4    0.74       7
D21S1919    41.8    0.81      10
D21S1260    51.6    0.74       7


Chromosome 22

D22S420        0    0.76       8
D22S539        9    0.58       7
D22S315     16.2    0.79      11
D22S280     25.9    0.81       7
D22S283     33.4    0.89      13
D22S274     45.5    0.76       7
D22S1169    58.1    0.78       7


Chromosomes X & Y

DXYS233        0    0.81      11
DXYS228      4.9    0.68      15
DXS996      10.8    0.85      13
DXS7108     18.5    0.74       9
DXS999      28.1    0.74       9
DXS1226     36.8    0.84      12
DXS1202     41.7    0.77       8
DXS1214     46.2    0.78       7
DXS1068     56.2    0.67      11
DXS993      66.1    0.78       8
DXS1003       77     0.8      11
DXS991      86.9    0.86      15
DXS8060     96.2    0.77       8
DXS990     104.9    0.75       8
DXS8034    113.5     0.7       6
DXS1059      121    0.71       8
DXS8081    126.1    0.64       5
DXS8067    136.5    0.73      10
DXS8098    143.1    0.65       6
DXS8072    151.1    0.72       9
DXS984     159.5    0.71      10
DXS1205    163.7    0.65       7
DXS8106    173.6    0.72      13
DXS998     183.8    0.58       4
DXS8011    190.4    0.84      13
DXS8087    198.1    0.69       4